Violante Beatrice s-a născut pe 23 ianuarie 1673 la Munchen, fiind cel mai mic copil al lui Ferdinand, elector de Bavaria, și al Henriettei Adelaide de Savoia.
În 1699 Marele Duce Cosimo al III-lea de Toscana s-a gândit tânăra ar fi o mireasă potrivită pentru Ferdinando, fiul său cel mare și moștenitor ducatului, mai ales pentru că Bavaria era unul dintre cele mai puternice state ale Sfântului Imperiu Roman. Totuși, relațiile dintre Munchen și Florența erau înghețate de ceva vreme pentru că tatăl lui Cosimo, Ferdinando al II-lea, îl înșelase pe tatăl Violantei cu o sumă mare de bani.
Pentru a obține mâna Violantei Beatrice pentru Marele Prinț, Cosimo a fost obligat să-și ramburseze datoria și după ce acest obstacol a fost depășit, cele două case nobiliare au semnat contractul de căsătorie al tinerilor. Prințesa a primit o zestre de 400.000 de taleri în numerar și aceeași sumă în bijuterii, s-a căsătorit cu Ferdinando prin procură pe 21 noiembrie 1688 și imediat a plecat spre noua ei țară. Violante și prințul s-au cunoscut și s-au căsătorit în persoană pe 9 ianuarie 1689, iar eremonia religioasă a fost însoțită de o recepție organizată la Palazzo Medici Riccardi din Florența. În ciuda faptului că a detestat-o pe nora lui, pentru că o considera urâtă, Cosimo al III-lea a insistat ca fiul său să-și respecte soția care adusese atât de mulți bani în căsătorie, dar mariajul celor doi nu a fost deloc fericit.
După șase ani, cuplul ducal nu reușise să aibă niciun moștenitor, iar Marele Duce, îngrijorat de soarte ducatului, a decis să fie organizată o rugăciune publică cu durata de trei zile, sperând că astfel problemele de fertilitate ale Violantei se vor rezolva.
Totuși, în scurt timp orice speranță de apariție a unui moștenitor a fost spulberată pentru că Ferdinando s-a îmbolnăvit în 1696 de sifilis în timpul Carnavalului de la Veneția, boală de care va muri șaptesprezece ani mai târziu.
Între timp, Marea Prințesă a căzut victimă unei depresii, se afla într-o permanentă stare de melancolie, iar singurul care a încercat să o consoleze a fost cumnatului ei, Prințul Gian Gastone, care s-a apropiat de biata fată în acea perioadă. Violante Beatrice făcea rareori aluzii la suferința sa în public, dar se pare că la un moment dat ar fi spus că Cecchino de Castris, amanta de la acea vreme a soțului ei, este motivul tuturor problemelor din căsnicie, iar faptul că Ferdinando spunea adesea că soția sa este “prea plictisitoare și prea urâtă” nu a făcut decât să înrăutățească lucrurile.
Marele Prinț a murit de sifilis pe 31 octombrie 1713, declanșând o criză de succesiune în ducat și lăsându-și soția văduvă fără copii și, prin urmare, fără niciun rol la curtea de la Florența, iar Violante a suferit enorm pentru că nu reușise să-și îndeplinească misiunea. S-a îmbolnăvit și a avut nevoie de asistența medicilor, iar socrul ei, Cosimo al III-lea, i-a oferit un set de safire albastre în semn de doliu. În acea perioadă Violante Beatrice s-a gândit să se întoarcă în țara ei natală, dar a aflat de intenția Annei Maria Luisa de’ Medici, născută prințesă toscană, care ar fi vrut să se întoarcă în ducat pentru a-i uzurpa poziția, și s-a răzgândit.
Pentru a înăbuși orice conflict privind prioritatea la curte, socrul ei, Cosimo al III-lea, a numit-o pe prințesa văduvă guvernatoare a Sienei și i-a oferit atribuții care au ținut-o departe de Florența, iar prințesa a primit apoi drept compensație reședința Villa di Lappeggi, care a devenit un fel de academie literară.
În aprilie 1717 prințesa și-a preluat funcția oficială din Siena, alegându-și un palat în centrul orașului și s-a ocupat cu mult devotament de sarcinile ei administrative. Marele Duce Cosimo al III-lea a murit pe 31 octombrie 1723, fiind urmat la tron de Gian Gastone, care și-a amintit imediat de Violante Beatrice, a invitat-o să vină la Florența și și-a alungat sora, pe Anna Maria Luisa de’ Medici, adversara veche a ducesei, la Villa La Quiete.
În următorii ani Violante Beatrice a dominat curtea ducală, mai ales după ce Gian Gastone a renunțat la toate îndatoririle publice în favoarea ei, alegând pur și simplu să-și petreacă cea mai mare parte a timpului în pat. Violante Beatrice, onorată de misiunea pe care a primit-o, a instituit moda franceză la curte, a încurajat viața literară și a încercat să imprime o viziune modernă de conducere a ducatului.
Violante Beatrice de Bavaria, Marea Prințesă a Toscanei și guvernatoare de Siena, a murit pe 30 mai 1731, la vârsta de 58 de ani la Palazzo Pitti, rămășițele ei fiind depuse la Mănăstirea Sfânta Tereza din Florența, iar inima a fost așezată în sicriul soțului din necropola San Lorenzo de’ Medici.
